Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SrfQ9JM73 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrfQ9JM73 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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