Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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