Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms