Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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