Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bhlhe41Q99PV5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms