Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms