Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hdac7Q8C2B3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms