Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms