Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms