Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm13592-201ENSMUST00000118148 1010 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm10120-201ENSMUST00000219845 357 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms