Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf48Q3US17 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms