Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5460Q3UQ97 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms