Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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