Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms