Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm8314-201ENSMUST00000208964 1858 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccbe1Q3MI99 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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