Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc39dQ0VF76 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc39dQ0VF76 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc39dQ0VF76 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc39dQ0VF76 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc39dQ0VF76 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ttc39dQ0VF76 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39dQ0VF76 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms