Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PrcdQ00LT2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms