Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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