Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms