Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms