Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms