Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms