Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf6Q9DBU5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf6Q9DBU5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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