Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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