Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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