Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Khdc3Q9CWU5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms