Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms