Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms