Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms