Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Card11Q8CIS0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Card11Q8CIS0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms