Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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