Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms