Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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