Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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