Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms