Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms