Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms