Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pcx-202ENSMUST00000113825 4044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm10741-201ENSMUST00000218151 1748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Chat-201ENSMUST00000070125 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm26601-201ENSMUST00000181427 3551 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm17249-201ENSMUST00000181277 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 4933432K03Rik-203ENSMUST00000206276 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ect2l-203ENSMUST00000207827 2730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 4931431C16Rik-201ENSMUST00000124643 2735 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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