Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Irf1P15314 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Irf1P15314 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms