Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Itgb1P09055 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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