Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CrxO54751 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms