Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zbed5B2RPU8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms