Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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