Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms