Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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