Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clstn1Q9EPL2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms