Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ift46Q9DB07 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ift46Q9DB07 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms