Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c6Q9D8P7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gtf3c6Q9D8P7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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