Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms