Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms